
Curso de análisis de microbiomas con R #08: Correlación de variables
¡Llegamos a una de las partes más interesantes!
Hasta ahora hemos explorado la diversidad y los taxones clave en nuestras muestras, pero ¿qué pasa con las variables ambientales o condiciones que pueden estar influyendo en esas comunidades microbianas?
En esta clase aprenderemos a:
• Añadir variables ambientales o clínicas a nuestros datos (al menos, para que veas cómo se trabaja en estos casos)
• Explorar si la diversidad alfa se relaciona con esas variables
• Ver si la abundancia de ciertos taxones clave cambia con condiciones ambientales
• Visualizar estas relaciones para entender mejor esas relaciones
Así podrás ir más allá de comparar grupos y comenzar a descubrir patrones de interacción entre el ambiente y la microbiota.
Todo lo haremos con código sencillo y ejemplos directos para que puedas aplicar estas técnicas en tus propios datos.
¡A por esas conexiones entre microbioma y ambiente!